More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7010 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7010  parB-like partition protein  100 
 
 		 352 aa  721    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471525  hitchhiker  0.00731349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3027  ParB family protein  94.03 
 
 		 352 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4152  parB-like partition protein  82.95 
 
 		 354 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2372  parB family protein  81.25 
 
 		 355 aa  588  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0244608  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3290  ParB family protein  80.68 
 
 		 355 aa  587  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.015441  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2410  parB family protein  80.4 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.382726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2115  parB family protein  80.4 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00350884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3177  ParB family protein  80.4 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1504  parB family protein  80.4 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00121219  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1423  parB family protein  80.4 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00273947  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1144  parB family protein  80.4 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000253474  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3107  parB-like partition protein  80.23 
 
 		 353 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33324  normal  0.297937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4966  parB-like partition proteins  80.23 
 
 		 353 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00677136  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0004  ParB family protein  79.38 
 
 		 353 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3161  parB-like partition protein  79.78 
 
 		 353 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0319824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4542  parB-like partition protein  79.38 
 
 		 353 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0082945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5165  parB-like partition proteins  79.1 
 
 		 353 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276912  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5694  parB-like partition proteins  79.1 
 
 		 353 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  hitchhiker  0.0013733 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6161  parB-like partition protein  35.48 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7738  ParB family protein  34.54 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5757  parB-like partition protein  35.08 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6001  parB-like partition proteins  35.08 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6671  parB-like partition protein  34.96 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.612452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5827  parB-like partition proteins  34.96 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6194  parB-like partition proteins  34.96 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.221431 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5081  parB-like partition protein  29.76 
 
 		 345 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0004  putative partitioning protein  30.97 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00180534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5174  parB-like partition protein  28.12 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1509  parB-like partition protein  28.12 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240811  normal  0.318219 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5820  plasmid partition protein  31.3 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  29.28 
 
 		 336 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3784  parB-like partition protein  29.85 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3897  parB-like partition protein  29.85 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4247  parB-like partition proteins  30.29 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6251  parB-like partition protein  27.25 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0469124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6874  parB-like partition proteins  28.73 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4934  parB-like partition proteins  27.85 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.190039  normal  0.260237 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5044  ParB family protein  25.74 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4471  parB-like partition proteins  21.07 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000480201  decreased coverage  1.87892e-20 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4284  parB-like partition proteins  26.11 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  30.37 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  27.48 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  26.67 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7548  parB-like partition protein  26.12 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  26.19 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  26.19 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  27.23 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  26.98 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  27.35 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  27.56 
 
 		 401 aa  67  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  30.28 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  30.81 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  31 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  28 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  29.19 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  24.69 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  26.3 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  22.81 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  27.65 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  24.89 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  27.36 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  27.27 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  30.23 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  25.49 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  28.93 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  26.64 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  25.96 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  28.85 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  28.85 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  28.41 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  26.98 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  28.85 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  26.24 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  26.01 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5514  hypothetical protein  26.44 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  26.96 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  27.1 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  26.6 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  30.2 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  30.2 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  30.2 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  30.2 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  30.2 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  30.2 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  26.73 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  24.32 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  27.05 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  31.29 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  30.61 
 
 		 290 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  27 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  26.13 
 
 		 282 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  26.51 
 
 		 268 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  27 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  27 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  27.86 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  28.4 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  27.62 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  27.4 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  28.98 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>