More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3784 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3784  parB-like partition protein  100 
 
 		 335 aa  681    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3897  parB-like partition protein  100 
 
 		 335 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0004  putative partitioning protein  89.85 
 
 		 334 aa  614  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00180534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  75.15 
 
 		 336 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5820  plasmid partition protein  71.98 
 
 		 338 aa  504  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4471  parB-like partition proteins  38.24 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000480201  decreased coverage  1.87892e-20 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4542  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0082945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3161  parB-like partition protein  31.09 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0319824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3107  parB-like partition protein  30.6 
 
 		 353 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33324  normal  0.297937 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5081  parB-like partition protein  34.03 
 
 		 345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4966  parB-like partition proteins  30.6 
 
 		 353 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00677136  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5165  parB-like partition proteins  30.22 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276912  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5694  parB-like partition proteins  30.22 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  hitchhiker  0.0013733 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2372  parB family protein  31.46 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0244608  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3290  ParB family protein  31.09 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.015441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2115  parB family protein  31.09 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00350884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1144  parB family protein  31.09 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000253474  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1504  parB family protein  31.09 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00121219  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2410  parB family protein  31.09 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.382726  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1423  parB family protein  31.09 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00273947  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3177  ParB family protein  31.09 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691311  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4152  parB-like partition protein  29.85 
 
 		 354 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0004  ParB family protein  29.85 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3027  ParB family protein  30.6 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7010  parB-like partition protein  29.85 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471525  hitchhiker  0.00731349 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6161  parB-like partition protein  28.67 
 
 		 341 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5757  parB-like partition protein  27.97 
 
 		 343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6671  parB-like partition protein  28.97 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.612452 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6001  parB-like partition proteins  27.97 
 
 		 343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6194  parB-like partition proteins  28.97 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.221431 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5827  parB-like partition proteins  29.12 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7738  ParB family protein  27.59 
 
 		 343 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1509  parB-like partition protein  28.49 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240811  normal  0.318219 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5174  parB-like partition protein  28.49 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6251  parB-like partition protein  26.62 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0469124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  29.74 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  33.49 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4247  parB-like partition proteins  29.72 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241941  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  29.74 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  29.74 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6874  parB-like partition proteins  26.72 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  28.43 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  32.14 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  30.05 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  27.17 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  31.73 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  32.13 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  26.87 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  26.9 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  31.19 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  29.91 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  29.9 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  29.7 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  27.27 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  28.83 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  30.61 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  29.67 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  29.49 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  28.83 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  30.81 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5044  ParB family protein  25.88 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  30 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  31.37 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  26.72 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  26.84 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  28.25 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  28.25 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  31.31 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  31.31 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  30.81 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  31.31 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  27.27 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  26.84 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  30.99 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  26.41 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  28.25 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  27.8 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  27.59 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  29.77 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  27.27 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  28.85 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  27.8 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  27.8 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  32.88 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  29.8 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  28.3 
 
 		 256 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  29.76 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4934  parB-like partition proteins  25.63 
 
 		 331 aa  67  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.190039  normal  0.260237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  25.55 
 
 		 299 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  31.12 
 
 		 392 aa  67  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  28.7 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  29.31 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  25.83 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  28.32 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6316  chromosome partitioning protein ParB  25.91 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  27.05 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  28.3 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  25.97 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  28.86 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>