More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4152 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4152  parB-like partition protein  100 
 
 		 354 aa  724    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3027  ParB family protein  83.19 
 
 		 352 aa  607  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7010  parB-like partition protein  82.34 
 
 		 352 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471525  hitchhiker  0.00731349 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3290  ParB family protein  81.92 
 
 		 355 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.015441  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2372  parB family protein  80.28 
 
 		 355 aa  586  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0244608  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2115  parB family protein  81.41 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00350884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1144  parB family protein  81.41 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000253474  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1504  parB family protein  81.41 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00121219  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2410  parB family protein  81.41 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.382726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3177  ParB family protein  81.41 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1423  parB family protein  81.41 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00273947  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3161  parB-like partition protein  79.49 
 
 		 353 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0319824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4966  parB-like partition proteins  79.26 
 
 		 353 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00677136  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3107  parB-like partition protein  79.26 
 
 		 353 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33324  normal  0.297937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4542  parB-like partition protein  77.4 
 
 		 353 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0082945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0004  ParB family protein  77.68 
 
 		 353 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5165  parB-like partition proteins  76.82 
 
 		 353 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276912  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5694  parB-like partition proteins  76.82 
 
 		 353 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  hitchhiker  0.0013733 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6161  parB-like partition protein  34.09 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7738  ParB family protein  33.96 
 
 		 343 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6671  parB-like partition protein  33.97 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.612452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5827  parB-like partition proteins  36.18 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6194  parB-like partition proteins  33.97 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.221431 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6001  parB-like partition proteins  33.97 
 
 		 343 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5757  parB-like partition protein  33.97 
 
 		 343 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0004  putative partitioning protein  30.34 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00180534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5081  parB-like partition protein  29.73 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5174  parB-like partition protein  29.55 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1509  parB-like partition protein  29.55 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240811  normal  0.318219 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3784  parB-like partition protein  29.85 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3897  parB-like partition protein  29.85 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5820  plasmid partition protein  30.92 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  30.08 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4247  parB-like partition proteins  32.59 
 
 		 324 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6251  parB-like partition protein  28.36 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0469124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6874  parB-like partition proteins  28.36 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5044  ParB family protein  26.02 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4934  parB-like partition proteins  28.69 
 
 		 331 aa  89.7  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.190039  normal  0.260237 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  28.14 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  26.3 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  26.3 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4471  parB-like partition proteins  20.33 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000480201  decreased coverage  1.87892e-20 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  26.04 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4284  parB-like partition proteins  30.49 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  30.37 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  26.36 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  27.52 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  27.52 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  27.11 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  27.52 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  28.44 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  27.52 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  25.58 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  26.29 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  27.06 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5514  hypothetical protein  25.77 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  29.82 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  27.06 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  27.06 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  27.06 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  27.06 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  28.79 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  31.2 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  26.05 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  26.61 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  30.28 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  26.96 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  28.64 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  32.64 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  27.06 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  29.13 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  27.57 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  26.24 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  28.89 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  27.15 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  26.24 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  28.28 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  28.64 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7548  parB-like partition protein  25.56 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  26.7 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  25.3 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  25 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  30.2 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  32.1 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  26.92 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  28.18 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  27.33 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  29.7 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  29.7 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  24.57 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  28.77 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  29.7 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  29.09 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1409  ParB-like partition protein  23.64 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  31.82 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  24.66 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  27.09 
 
 		 289 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  25 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  26.84 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  29.95 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>