More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5820 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5820  plasmid partition protein  100 
 
 		 338 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  85.21 
 
 		 336 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3784  parB-like partition protein  71.98 
 
 		 335 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3897  parB-like partition protein  71.98 
 
 		 335 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0004  putative partitioning protein  71.3 
 
 		 334 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00180534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4471  parB-like partition proteins  39.55 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000480201  decreased coverage  1.87892e-20 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2372  parB family protein  32.33 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0244608  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1144  parB family protein  31.95 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000253474  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3177  ParB family protein  31.95 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691311  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2115  parB family protein  31.95 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00350884  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1423  parB family protein  31.95 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00273947  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1504  parB family protein  31.95 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00121219  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2410  parB family protein  31.95 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.382726  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3290  ParB family protein  31.95 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.015441  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4542  parB-like partition protein  29.75 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0082945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3027  ParB family protein  32.06 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3161  parB-like partition protein  31.2 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0319824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3107  parB-like partition protein  31.2 
 
 		 353 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33324  normal  0.297937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4966  parB-like partition proteins  31.2 
 
 		 353 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00677136  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5694  parB-like partition proteins  30.83 
 
 		 353 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  hitchhiker  0.0013733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5165  parB-like partition proteins  30.83 
 
 		 353 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276912  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5081  parB-like partition protein  29.67 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4152  parB-like partition protein  30.92 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7010  parB-like partition protein  31.3 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471525  hitchhiker  0.00731349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0004  ParB family protein  29.45 
 
 		 353 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7738  ParB family protein  28.46 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6194  parB-like partition proteins  28.12 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.221431 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5757  parB-like partition protein  29.32 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6161  parB-like partition protein  28.97 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6001  parB-like partition proteins  29.32 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6671  parB-like partition protein  28.29 
 
 		 343 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.612452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5827  parB-like partition proteins  27.78 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1509  parB-like partition protein  28.62 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240811  normal  0.318219 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5174  parB-like partition protein  28.62 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4247  parB-like partition proteins  27.66 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6251  parB-like partition protein  25.86 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0469124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  31.48 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  31.47 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  30.1 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  30.58 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  30.58 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  32.04 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  33.02 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  33 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  33 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  29.9 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6874  parB-like partition proteins  26.99 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  27.56 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  32.02 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  27.07 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  27.07 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  27.07 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  27.07 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  26.64 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  27.07 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  31.76 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  28 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  30.16 
 
 		 529 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  28 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  25.69 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5514  hypothetical protein  29.61 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  26.37 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  26.41 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  30.04 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  30 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  26.64 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  32.31 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  31.43 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  26.64 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  29.77 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  26.51 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  32.27 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  29.44 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 323 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  26.94 
 
 		 283 aa  72  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  26.51 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  28.4 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  27.1 
 
 		 303 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  26.91 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  29.49 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  29.67 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  30.47 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  29.85 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  33.17 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5044  ParB family protein  22.69 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  29.7 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  30.88 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  31.63 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  32.16 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  28.99 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  27.61 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  26.9 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  29.77 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  28.19 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  27.56 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  27.56 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  27.4 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  29.21 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  32.09 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  29.77 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>