26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1104 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1104  putative plasmid partition protein  100 
 
 
324 aa  663    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000994  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB  69.66 
 
 
324 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0131  ParB family protein  68.83 
 
 
323 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07050  hypothetical protein  69.97 
 
 
324 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_41  putative plasmid partition protein B  35.23 
 
 
335 aa  146  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0344008  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0008  plasmid-partitioning protein  34.01 
 
 
321 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.188709 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4251  plasmid-partitioning protein  32.32 
 
 
322 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0980763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  30.52 
 
 
323 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  30.92 
 
 
323 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  30.92 
 
 
323 aa  92  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  31.13 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0155  virulence regulon transcriptional activator VirB  32.18 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08266  plasmid partition protein ParB  35.47 
 
 
356 aa  86.7  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3947  parB-like partition protein  31.33 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00257685  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0096  plasmid partition protein ParB  30.53 
 
 
364 aa  63.5  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0053  plasmid Partition par B protein  34.36 
 
 
326 aa  62.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4365  ParB family protein  30.32 
 
 
365 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0572236  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4452  ParB family protein  29.79 
 
 
365 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0140271  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4547  ParB family protein  29.26 
 
 
365 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5036  parB-like partition proteins  29.38 
 
 
321 aa  59.3  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5336  parB-like partition protein  28.85 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.557995 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3590  parB-like partition protein  29.3 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5044  ParB family protein  30.66 
 
 
332 aa  46.2  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3917  parB-like partition protein  25.83 
 
 
327 aa  45.8  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  31.82 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4225  hypothetical protein  23.29 
 
 
357 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.699695  normal  0.542878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>