More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3014 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3014  ParB family protein  100 
 
 		 306 aa  612  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.584677 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  36.08 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  34.18 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  36.36 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  36.36 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  32.1 
 
 		 288 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  31.41 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  29.58 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  30 
 
 		 283 aa  85.9  7e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  38.22 
 
 		 302 aa  85.9  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  31.45 
 
 		 257 aa  85.5  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  38.21 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  31.14 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  31.34 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  31.14 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  30.88 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  31.18 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  34.81 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  31.25 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  38 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  33.97 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  37.33 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  35.03 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  29.44 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  33.12 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  32.91 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  28.48 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  31.11 
 
 		 392 aa  79.3  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  33.12 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  31.87 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  33.12 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  33.12 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  38.33 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  34.19 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  29.25 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  29.25 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  29.65 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  29.65 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  34.19 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  33.55 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  29.15 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  33.55 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  35.15 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  33.95 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  28.09 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  35.9 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  33.55 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  31.65 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  35.81 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  37.23 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  31.65 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  34.75 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  35.07 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  37.59 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  35.59 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  35.07 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  35.07 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  33.12 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  32.47 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  35 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  34.75 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  33.55 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4390  parB-like partition protein  32.89 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  33.77 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  30.67 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  30.72 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  34.48 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  30.19 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  28.26 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  30.67 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  30.63 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  27.84 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  31.29 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  30.39 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  31.37 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  32.89 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  31.25 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  31.09 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  32.26 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  32.26 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  32.26 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  29.94 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  32.89 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  32.26 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4975  parB-like partition protein  26.62 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  30.43 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  31.76 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  32.26 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  32.26 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  34.21 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  32.26 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  29.27 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  32.48 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  32.89 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  29.41 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>