25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0131 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0131  ParB family protein  100 
 
 		 323 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000994  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB  75.54 
 
 		 324 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07050  hypothetical protein  75.54 
 
 		 324 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1104  putative plasmid partition protein  68.83 
 
 		 324 aa  462  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_41  putative plasmid partition protein B  34.27 
 
 		 335 aa  142  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0344008  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0008  plasmid-partitioning protein  37.11 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.188709 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4251  plasmid-partitioning protein  29.86 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0980763 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  31.07 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  30.36 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  30.36 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  29.64 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3947  parB-like partition protein  34.97 
 
 		 382 aa  85.9  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00257685  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0155  virulence regulon transcriptional activator VirB  33.7 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08266  plasmid partition protein ParB  35 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0053  plasmid Partition par B protein  30.98 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4452  ParB family protein  30.27 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0140271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4365  ParB family protein  30.27 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0572236  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0096  plasmid partition protein ParB  29.73 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4547  ParB family protein  29.89 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5036  parB-like partition proteins  30.19 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4225  hypothetical protein  26.27 
 
 		 357 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.699695  normal  0.542878 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5336  parB-like partition protein  26.82 
 
 		 343 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.557995 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  25 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  30.57 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  30.09 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>