19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4452 on replicon NC_009661
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0096  plasmid partition protein ParB  93.41 
 
 		 364 aa  695    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4365  ParB family protein  99.18 
 
 		 365 aa  734    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0572236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4452  ParB family protein  100 
 
 		 365 aa  738    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0140271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4547  ParB family protein  97.81 
 
 		 365 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08266  plasmid partition protein ParB  64.33 
 
 		 356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0053  plasmid Partition par B protein  40.47 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0155  virulence regulon transcriptional activator VirB  28.72 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4225  hypothetical protein  28.5 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.699695  normal  0.542878 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000994  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB  34.3 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07050  hypothetical protein  32.22 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0131  ParB family protein  30.27 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1104  putative plasmid partition protein  29.79 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0008  plasmid-partitioning protein  30.69 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.188709 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_41  putative plasmid partition protein B  28.36 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0344008  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4251  plasmid-partitioning protein  28.33 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0980763 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  28.37 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  28.37 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  27.83 
 
 		 323 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  28.11 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>