33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1165 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1165  MT-A70 family protein  100 
 
 
305 aa  635    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  38.33 
 
 
426 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  28.44 
 
 
507 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  30.3 
 
 
435 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5079  MT-A70 family protein  34.97 
 
 
187 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2137  MT-A70 family protein  35.2 
 
 
224 aa  96.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3839  MT-A70 family protein  33.88 
 
 
187 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2489  MT-A70 family protein  33.7 
 
 
188 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0901291  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0660  MT-A70 family protein  31.11 
 
 
202 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0246  adenine-specific DNA methyltransferase  32.99 
 
 
216 aa  92.8  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.298743  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1288  MT-A70 family protein  34.86 
 
 
201 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2112  MT-A70 family protein  34.86 
 
 
201 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193598  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3618  MT-A70 family protein  34.46 
 
 
194 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.92147  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0426  MT-A70 family protein  31.15 
 
 
229 aa  89.4  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2608  MT-A70  31.82 
 
 
226 aa  89.4  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3884  MT-A70 family protein  30.34 
 
 
208 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4092  MT-A70 family protein  31.11 
 
 
193 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1679  MT-A70  31.58 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43977  predicted protein  29.89 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0538105  normal  0.400079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  25.61 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4628  MT-A70 family protein  30.89 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000658429  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2063  MT-A70 family protein  30.6 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.524395  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2710  MT-A70 family protein  28.35 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0620  MT-A70  27.05 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57562  activator of IME1 Predicted N6-adenine RNA methylase IME4  28.16 
 
 
531 aa  67.4  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1616  MT-A70 family protein  27.53 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03860  mRNA methyltransferase, putative  28.87 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3576  adenine methylase  28.65 
 
 
208 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000695706 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1143  adenine methylase  28.65 
 
 
200 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0265355  hitchhiker  1.9630399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3316  hypothetical protein  29.76 
 
 
168 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7351  MT-A70 family protein  35.59 
 
 
130 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94457  predicted protein  26.71 
 
 
386 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1554  hypothetical protein  25.77 
 
 
750 aa  43.1  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>