36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0246 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0246  adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 		 216 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.298743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2608  MT-A70  81.94 
 
 		 226 aa  371  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0426  MT-A70 family protein  74.15 
 
 		 229 aa  331  7.000000000000001e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2137  MT-A70 family protein  73.85 
 
 		 224 aa  285  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3884  MT-A70 family protein  70.37 
 
 		 208 aa  265  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2063  MT-A70 family protein  66.49 
 
 		 211 aa  263  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.524395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4628  MT-A70 family protein  47.16 
 
 		 186 aa  148  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000658429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  38.86 
 
 		 426 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5079  MT-A70 family protein  40.23 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3839  MT-A70 family protein  39.66 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  38.2 
 
 		 401 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2489  MT-A70 family protein  37.91 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0901291  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0620  MT-A70  37.24 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4092  MT-A70 family protein  38.29 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1679  MT-A70  39.33 
 
 		 190 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1288  MT-A70 family protein  34.9 
 
 		 201 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2112  MT-A70 family protein  34.9 
 
 		 201 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  36.57 
 
 		 507 aa  99  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0660  MT-A70 family protein  34.86 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1165  MT-A70 family protein  32.99 
 
 		 305 aa  92.8  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  36.31 
 
 		 435 aa  92.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2710  MT-A70 family protein  33.82 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3576  adenine methylase  37.02 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000695706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1616  MT-A70 family protein  28.72 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3618  MT-A70 family protein  33.51 
 
 		 194 aa  85.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.92147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1143  adenine methylase  32.97 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0265355  hitchhiker  1.9630399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43977  predicted protein  31.46 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0538105  normal  0.400079 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2064  Transcriptional activator adenine-specific DNA methyltransferase-like protein  40.71 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000107502  normal  0.010036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7351  MT-A70 family protein  43.1 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3316  hypothetical protein  33.67 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1554  hypothetical protein  29.38 
 
 		 750 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03860  mRNA methyltransferase, putative  29.32 
 
 		 406 aa  62.4  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57562  activator of IME1 Predicted N6-adenine RNA methylase IME4  29.05 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00700  transcription regulator, putative  29.14 
 
 		 586 aa  49.3  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.960163  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94457  predicted protein  26.22 
 
 		 386 aa  49.3  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.06 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>