31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1143 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1143  adenine methylase  100 
 
 		 200 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0265355  hitchhiker  1.9630399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3576  adenine methylase  79.19 
 
 		 208 aa  347  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000695706 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1679  MT-A70  38.2 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0443  MT-A70 family protein  35.52 
 
 		 426 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516252  hitchhiker  0.000000000100538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0620  MT-A70  34.03 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2710  MT-A70 family protein  34.55 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  34.27 
 
 		 401 aa  90.5  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2112  MT-A70 family protein  37.5 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1288  MT-A70 family protein  37.5 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2137  MT-A70 family protein  32.78 
 
 		 224 aa  85.1  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4628  MT-A70 family protein  33.71 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000658429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0246  adenine-specific DNA methyltransferase  32.97 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.298743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4092  MT-A70 family protein  34.95 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2608  MT-A70  32.24 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0660  MT-A70 family protein  31.02 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3618  MT-A70 family protein  33.7 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.92147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3839  MT-A70 family protein  32.11 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2318  MT-A70 family protein  29.57 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2489  MT-A70 family protein  31.58 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0901291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2063  MT-A70 family protein  31.91 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.524395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0426  MT-A70 family protein  28.42 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3884  MT-A70 family protein  32.42 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5079  MT-A70 family protein  31.05 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1667  MT-A70 family protein  28.49 
 
 		 507 aa  71.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.584736  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1554  hypothetical protein  27.62 
 
 		 750 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1165  MT-A70 family protein  28.65 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43977  predicted protein  27.07 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0538105  normal  0.400079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1616  MT-A70 family protein  25.5 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2064  Transcriptional activator adenine-specific DNA methyltransferase-like protein  32.99 
 
 		 122 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000107502  normal  0.010036 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3316  hypothetical protein  37.5 
 
 		 168 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2615  hypothetical protein  48.72 
 
 		 45 aa  41.2  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00449211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>