14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2455 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2455  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2274  hypothetical protein  75.86 
 
 		 294 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2784  hypothetical protein  75.17 
 
 		 325 aa  362  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290619  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3997  hypothetical protein  62.54 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3753  hypothetical protein  58.36 
 
 		 288 aa  316  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0328  hypothetical protein  60.07 
 
 		 262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00473  hypothetical protein  57.86 
 
 		 284 aa  300  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2492  hypothetical protein  55.44 
 
 		 281 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000428836 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1328  hypothetical protein  55.91 
 
 		 292 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977322  normal  0.0373251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3855  hypothetical protein  52.84 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3648  hypothetical protein  29.77 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  27.95 
 
 		 401 aa  65.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1622  hypothetical protein  27.96 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  26.62 
 
 		 483 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>