14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2784 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2784  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  646    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290619  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2274  hypothetical protein  98.3 
 
 
294 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2455  hypothetical protein  75.17 
 
 
289 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3753  hypothetical protein  60.47 
 
 
288 aa  319  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0328  hypothetical protein  60.07 
 
 
262 aa  309  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00473  hypothetical protein  57.67 
 
 
284 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3997  hypothetical protein  60.07 
 
 
306 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742169  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1328  hypothetical protein  55.88 
 
 
292 aa  275  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977322  normal  0.0373251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2492  hypothetical protein  54.48 
 
 
281 aa  268  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000428836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3855  hypothetical protein  52.3 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3648  hypothetical protein  30.18 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  27.95 
 
 
401 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1622  hypothetical protein  25 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  28.17 
 
 
483 aa  49.7  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>