14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0328 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0328  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  529  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3753  hypothetical protein  63.48 
 
 		 288 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3997  hypothetical protein  63.95 
 
 		 306 aa  316  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00473  hypothetical protein  60.87 
 
 		 284 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3855  hypothetical protein  61.15 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2492  hypothetical protein  58.7 
 
 		 281 aa  292  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000428836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2455  hypothetical protein  59.01 
 
 		 289 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1328  hypothetical protein  58.6 
 
 		 292 aa  276  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977322  normal  0.0373251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2274  hypothetical protein  59.01 
 
 		 294 aa  276  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2784  hypothetical protein  59.72 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290619  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3648  hypothetical protein  27.31 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1622  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  26.89 
 
 		 401 aa  59.3  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  26.59 
 
 		 483 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>