14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2274 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2274  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  584  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2784  hypothetical protein  98.3 
 
 
325 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.290619  normal  0.79315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2455  hypothetical protein  75.86 
 
 
289 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3753  hypothetical protein  60.14 
 
 
288 aa  318  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0328  hypothetical protein  59.36 
 
 
262 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00473  hypothetical protein  58.33 
 
 
284 aa  308  8e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3997  hypothetical protein  60.07 
 
 
306 aa  298  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742169  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1328  hypothetical protein  55.88 
 
 
292 aa  276  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977322  normal  0.0373251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3855  hypothetical protein  52.65 
 
 
251 aa  271  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2492  hypothetical protein  54.48 
 
 
281 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000428836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3648  hypothetical protein  30.18 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1622  hypothetical protein  25.49 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.330271  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2604  MT-A70 family protein  27.95 
 
 
401 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0746  ParB domain protein nuclease  28.28 
 
 
483 aa  49.3  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>