222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2098 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  61.58 
 
 		 207 aa  215  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  60.47 
 
 		 190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  59.88 
 
 		 194 aa  211  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  59.17 
 
 		 195 aa  208  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  59.65 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  55.32 
 
 		 189 aa  202  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  52.06 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  55.1 
 
 		 209 aa  200  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  56.32 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  54.17 
 
 		 199 aa  184  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  52.04 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  52.97 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  49.75 
 
 		 205 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  50.27 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  49.75 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  51.91 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  51.91 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  51.91 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  51.91 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  51.91 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  49.74 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  53.01 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  48.69 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  52.46 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  50.27 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  51.02 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  51.02 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  46.23 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  51.05 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  50.76 
 
 		 200 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  49.19 
 
 		 191 aa  167  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  51.91 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  56.89 
 
 		 200 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  44.69 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  47.43 
 
 		 194 aa  141  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  45.56 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  42.11 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  41.35 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  41.55 
 
 		 173 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  41.35 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  36.5 
 
 		 175 aa  99  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  39.42 
 
 		 174 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  39.46 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  37.66 
 
 		 174 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  39.35 
 
 		 174 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  40.77 
 
 		 174 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  37.68 
 
 		 181 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  37.68 
 
 		 181 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  37.68 
 
 		 181 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  37.68 
 
 		 181 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  37.59 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  32.67 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  35.62 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  36.6 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  34.42 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  31.25 
 
 		 276 aa  78.6  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  33.33 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  32.19 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  38.1 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  33.1 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  30.3 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  32.62 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  30.3 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  29.27 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  34.48 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  33.09 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  28.28 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  23.87 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  32.89 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  24.18 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  24.18 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  23.87 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  30.82 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  22.58 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  27.03 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  29.89 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  25.48 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  28.16 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  31.51 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 319 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2902  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2946  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2932  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202849  normal  0.0386986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  36.19 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  28.12 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 277 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  28.76 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>