122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5088 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  66.27 
 
 		 195 aa  228  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  67.27 
 
 		 189 aa  218  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  60.44 
 
 		 194 aa  214  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  60.44 
 
 		 190 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  57.87 
 
 		 192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  59.65 
 
 		 194 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  60.23 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  62.5 
 
 		 188 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  60.71 
 
 		 188 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  58.48 
 
 		 207 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  59.65 
 
 		 190 aa  191  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  57.78 
 
 		 205 aa  187  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  58.38 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  59.76 
 
 		 195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  57.99 
 
 		 200 aa  181  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  57.23 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  56.07 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  57.67 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  56.21 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  56.21 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  56.82 
 
 		 199 aa  174  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  56.8 
 
 		 200 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  55.88 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  58.05 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  55.43 
 
 		 187 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  52.51 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  53.41 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  52.87 
 
 		 205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  56.1 
 
 		 191 aa  164  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  53.41 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  52.87 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  52.87 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  52.87 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  52.87 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  48.24 
 
 		 172 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  48.52 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  44.72 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  39.87 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  35 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  37.65 
 
 		 176 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  44.09 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  37.66 
 
 		 177 aa  99.8  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  41.04 
 
 		 174 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  39.73 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  38.52 
 
 		 181 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  38.52 
 
 		 181 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  38.52 
 
 		 181 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  38.52 
 
 		 181 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  39.55 
 
 		 174 aa  95.5  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  41.73 
 
 		 176 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 168 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  35 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  33.54 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  31.25 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  33.95 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  28.12 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  34.18 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  33.55 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  28.92 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  35.47 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  27.63 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  32.8 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  37.23 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  37.23 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  22.02 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  35.59 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  30.32 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  30.91 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  31.58 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  31.34 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 251 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  31.39 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  20.89 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  20.89 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2599  tellurite resistance protein TehB  28.48 
 
 		 298 aa  48.9  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  29.69 
 
 		 177 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  27.88 
 
 		 298 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  25.36 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  28.21 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  45.24 
 
 		 255 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  36.96 
 
 		 291 aa  45.4  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 257 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  29.33 
 
 		 251 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 246 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  34.07 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  29.55 
 
 		 323 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  35 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  25.88 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  30.92 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>