207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1126 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  34.97 
 
 
194 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  31.29 
 
 
175 aa  88.6  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29824  predicted protein  24.18 
 
 
358 aa  86.7  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
176 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  31.71 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  35.25 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  30.67 
 
 
183 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  31.25 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  30.54 
 
 
177 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  30.41 
 
 
174 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  31.72 
 
 
174 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  28.31 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  29.68 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  32 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  30.86 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  34.11 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  30.95 
 
 
190 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
195 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  31.47 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  27.52 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  29.03 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  32.59 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  29.37 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  29.37 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  29.37 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  29.37 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  25.52 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  31.29 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  28.8 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  32.28 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  28.72 
 
 
199 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  28 
 
 
190 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  29.5 
 
 
195 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  27.63 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  26.38 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  27.63 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  30.6 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  28 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  28.81 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  29.51 
 
 
190 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  31.09 
 
 
205 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  30.14 
 
 
172 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  30.83 
 
 
200 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  30.83 
 
 
181 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  30.71 
 
 
194 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  26.8 
 
 
200 aa  63.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  27.52 
 
 
188 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  24.67 
 
 
182 aa  62.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  30.83 
 
 
200 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  26.03 
 
 
196 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  26.62 
 
 
183 aa  62.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
209 aa  62  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  32.31 
 
 
177 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  26.06 
 
 
191 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  27.69 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  30 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  30 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  30.22 
 
 
215 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  26.6 
 
 
211 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  25.78 
 
 
202 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  27.15 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  27.97 
 
 
200 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  29.03 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  26.89 
 
 
187 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  25 
 
 
211 aa  55.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  26.89 
 
 
205 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  26.89 
 
 
205 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  26.89 
 
 
205 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  26.62 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  26.89 
 
 
205 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  26.89 
 
 
205 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  26.89 
 
 
205 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  25.32 
 
 
208 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  25 
 
 
429 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2599  tellurite resistance protein TehB  27.81 
 
 
298 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  27.21 
 
 
204 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  23.7 
 
 
201 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  30.1 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  23.49 
 
 
200 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  26.63 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  25.53 
 
 
202 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  23.49 
 
 
200 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.08 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  35.44 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.08 
 
 
234 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  28.68 
 
 
226 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  26.67 
 
 
193 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  30.23 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.84 
 
 
229 aa  49.3  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.2 
 
 
245 aa  49.3  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  42.55 
 
 
198 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  38.18 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  38.18 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>