170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0986 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 188 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  97.87 
 
 		 188 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  80.75 
 
 		 190 aa  299  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  67.96 
 
 		 200 aa  237  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  69.54 
 
 		 205 aa  236  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  66.12 
 
 		 200 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  66.12 
 
 		 200 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  65.03 
 
 		 200 aa  233  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  66.12 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  66.85 
 
 		 200 aa  229  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  63.54 
 
 		 187 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  65.56 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  61.46 
 
 		 199 aa  225  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  66.85 
 
 		 200 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  62.43 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  62.43 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  62.43 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  62.43 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  62.43 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  62.43 
 
 		 205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  61.54 
 
 		 191 aa  216  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  60.77 
 
 		 205 aa  213  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  62.5 
 
 		 212 aa  198  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  63.87 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  60.22 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  62.87 
 
 		 195 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  59.54 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  55.21 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  60.36 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  57.93 
 
 		 190 aa  175  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  49.74 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  55.87 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  57.32 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  48.78 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  54.55 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  56.02 
 
 		 194 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  49.1 
 
 		 177 aa  147  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  45.91 
 
 		 173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  46.22 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  45.38 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  44.17 
 
 		 175 aa  104  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  38.31 
 
 		 173 aa  104  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  36.99 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  40.58 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  38.26 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  42.14 
 
 		 177 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  38.26 
 
 		 181 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  38.26 
 
 		 181 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  37.01 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  38.26 
 
 		 181 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  41.98 
 
 		 174 aa  97.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  36.84 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  38.73 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  37.88 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  39.46 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  39.46 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  33.52 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  29.68 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  34.09 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  39.74 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  31.76 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  34.13 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  34.21 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  34.51 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  35.71 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  32.37 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  35.63 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  27.97 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  36.43 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  34.88 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  28.68 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  28.85 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  40.65 
 
 		 252 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  33.9 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  35.67 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  31.98 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  32.41 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 319 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 304 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 202 aa  48.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  61.29 
 
 		 255 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  38.21 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  31.88 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  34.88 
 
 		 209 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  34.19 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  31.65 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  39.47 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  23.03 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  35.25 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3621  hypothetical protein  34.85 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.76 
 
 		 260 aa  46.2  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>