184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1082 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  97.87 
 
 		 188 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  79.14 
 
 		 190 aa  295  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  66.3 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  67.82 
 
 		 205 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  64.48 
 
 		 200 aa  230  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  64.48 
 
 		 200 aa  230  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  63.39 
 
 		 200 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  64.48 
 
 		 200 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  65.19 
 
 		 200 aa  225  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  61.88 
 
 		 187 aa  222  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  63.89 
 
 		 200 aa  221  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  59.9 
 
 		 199 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  65.19 
 
 		 200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  60.77 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  60.77 
 
 		 205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  60.77 
 
 		 205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  60.77 
 
 		 205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  60.77 
 
 		 205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  60.77 
 
 		 205 aa  214  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  60.44 
 
 		 191 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  59.12 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  60.71 
 
 		 212 aa  194  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2562  hypothetical protein  63.35 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0591078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  55.21 
 
 		 192 aa  188  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  59.12 
 
 		 191 aa  187  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  58.96 
 
 		 195 aa  187  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  61.68 
 
 		 195 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  59.17 
 
 		 189 aa  181  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  57.93 
 
 		 190 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  57.32 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  55.31 
 
 		 209 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  48.69 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  48.29 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2716  hypothetical protein  53.94 
 
 		 172 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  55.42 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  48.5 
 
 		 177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0846  hypothetical protein  44.65 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  44.54 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  44.54 
 
 		 176 aa  104  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  43.33 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  40.58 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  36.99 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  36.42 
 
 		 173 aa  101  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  38.26 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  37.01 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  38.26 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  38.26 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  38.26 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0972  hypothetical protein  41.43 
 
 		 177 aa  98.6  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  41.22 
 
 		 174 aa  92.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0907  methyltransferase type 12  36.18 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  39.31 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  34.09 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  37.12 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  38.78 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  38.78 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  34.09 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1126  hypothetical protein  29.03 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  31.76 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  37.32 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  39.07 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  34.51 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  35.71 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  32.89 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  28.67 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  35.63 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  32.37 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  34.92 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  28.68 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  28.85 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  29.33 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  41.46 
 
 		 252 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  31.69 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  35.67 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  38.21 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 319 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3284  hypothetical protein  35.61 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 304 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  32.77 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  34.11 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4460  hypothetical protein  35.61 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3906  hypothetical protein  35.61 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3621  hypothetical protein  35.61 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  61.29 
 
 		 255 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  23.03 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3800  hypothetical protein  34.85 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 257 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 253 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  39.47 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  31.72 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>