63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06550 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06550  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 195 aa  410  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000671  SAM-dependent methyltransferase  67.69 
 
 		 195 aa  296  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4807  Methyltransferase type 12  36.55 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0478  hypothetical protein  32 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0502  hypothetical protein  31 
 
 		 203 aa  88.2  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31140  methyltransferase family protein  34.16 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0609  Methyltransferase type 12  30.06 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6048  methyltransferase type 11  34.73 
 
 		 217 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.724013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5280  methyltransferase type 12  28.79 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11850  methyltransferase family protein  25.13 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0785893  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  32.04 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  24.58 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  31.25 
 
 		 1287 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 236 aa  49.3  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  22.42 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2140  methyltransferase type 12  28.36 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565614  normal  0.595745 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 265 aa  48.1  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  26.56 
 
 		 410 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  22.34 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 305 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  30.53 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  25.2 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  31.18 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  27.48 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.76 
 
 		 258 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  24.22 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  25.38 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  27.37 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2549  adenylylsulfate kinase  30.12 
 
 		 388 aa  45.1  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.064569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.92 
 
 		 257 aa  44.7  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  26.98 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  31.58 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  30.85 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.36 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  27.37 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  25.37 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 220 aa  42  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  25 
 
 		 236 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  32.98 
 
 		 192 aa  42  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 210 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  25.54 
 
 		 236 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  26.36 
 
 		 182 aa  41.6  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  24.22 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  25.37 
 
 		 236 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 246 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 246 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.39 
 
 		 243 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  21.88 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 240 aa  41.2  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 215 aa  41.2  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  26.19 
 
 		 236 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>