66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5280 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5280  methyltransferase type 12  100 
 
 		 207 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0478  hypothetical protein  36.22 
 
 		 206 aa  134  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0502  hypothetical protein  35.71 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0609  Methyltransferase type 12  39.41 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4807  Methyltransferase type 12  35.94 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000671  SAM-dependent methyltransferase  31.82 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6048  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.724013 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06550  dimethyladenosine transferase  28.79 
 
 		 195 aa  85.1  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31140  methyltransferase family protein  34.36 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11850  methyltransferase family protein  23.88 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0785893  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 248 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  25.95 
 
 		 295 aa  48.9  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  25.95 
 
 		 295 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  25.95 
 
 		 295 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.28 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.66 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.57 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.07 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  33.57 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.57 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.57 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.57 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0498  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216878  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.3 
 
 		 256 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.58 
 
 		 258 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  25.56 
 
 		 245 aa  45.1  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  24.77 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.53 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  25.93 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  46.15 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  25.56 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.86 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.07 
 
 		 252 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 254 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  32 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  25.56 
 
 		 246 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.35 
 
 		 347 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  32.04 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  40.62 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  40.62 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  30.63 
 
 		 408 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  33.01 
 
 		 250 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  29.46 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.65 
 
 		 258 aa  42  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  41.79 
 
 		 253 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  29.46 
 
 		 200 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.79 
 
 		 257 aa  42  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  30 
 
 		 256 aa  42  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  24.11 
 
 		 277 aa  42  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  31.31 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.66 
 
 		 257 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  56.76 
 
 		 407 aa  41.6  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  25.37 
 
 		 242 aa  41.6  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.83 
 
 		 256 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.29 
 
 		 262 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.6 
 
 		 346 aa  41.2  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.6 
 
 		 346 aa  41.6  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  24.27 
 
 		 275 aa  41.2  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.07 
 
 		 252 aa  41.2  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>