86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13140 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13140  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225832 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13353  methyltransferase  57 
 
 
204 aa  199  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.356592  normal  0.242787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28840  methyltransferase family protein  51.13 
 
 
256 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  32.74 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  31.64 
 
 
182 aa  59.3  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  37.31 
 
 
217 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
216 aa  58.2  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  32.12 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  33.56 
 
 
396 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  38.83 
 
 
208 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  27.27 
 
 
183 aa  54.7  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  30.41 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  26.94 
 
 
190 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  26.56 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  28.78 
 
 
181 aa  53.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
208 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  30.59 
 
 
179 aa  52.4  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  31.16 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  41 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  29.71 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  33.98 
 
 
214 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1324  methyltransferase type 11  36 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  40 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5471  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal  0.745032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5245  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.654942  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4966  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4877  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
227 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
259 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
259 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  30.28 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 
202 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  31.39 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  31.97 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  25.37 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  31.39 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  31.39 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
259 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  30.64 
 
 
195 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  36.43 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  30.67 
 
 
241 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  40.24 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  31.16 
 
 
202 aa  45.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  39.51 
 
 
210 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
202 aa  45.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  31.54 
 
 
191 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  27.27 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3243  methyltransferase type 12  32.09 
 
 
206 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0787423  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  31.97 
 
 
190 aa  45.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  28.15 
 
 
149 aa  45.1  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  34.65 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  29.75 
 
 
183 aa  44.7  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  33.83 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  36.03 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
218 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
280 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.33 
 
 
302 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.61 
 
 
253 aa  42.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
675 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  36.61 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  32.32 
 
 
259 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  33.64 
 
 
248 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 
194 aa  42  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
258 aa  42  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  29.41 
 
 
195 aa  42  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  31.29 
 
 
201 aa  42  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
215 aa  42  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  26.81 
 
 
194 aa  42  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.25 
 
 
255 aa  41.6  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  28.66 
 
 
273 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  30.34 
 
 
229 aa  41.6  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.33 
 
 
302 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  27.74 
 
 
200 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  35.71 
 
 
211 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  25.9 
 
 
174 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
241 aa  41.2  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>