More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0316 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0316  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 251 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 272 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2820  methyltransferase type 11  30.35 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  35.56 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  41.53 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.29 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  41.35 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  37.59 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 363 aa  65.5  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.74 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3485  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  39.86 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  40.68 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  38.69 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  42.57 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  27.21 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  27.94 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  41 
 
 		 1106 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  37.29 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  46.32 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  44.36 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  26.47 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  39.83 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  36.29 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  38.26 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  37.96 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  26.72 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.81 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  31.16 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.66 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  38.1 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0529  Methyltransferase type 11  39.77 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.636084 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  40.46 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  31.82 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  40.82 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  42.57 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  41.96 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  32.39 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  42.59 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1266  generic methyl-transferase  32.06 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  39.36 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  32.39 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  32.82 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.9 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  30.43 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  37.6 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  38.74 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.92 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.29 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  38.39 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  35.43 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 341 aa  57  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 341 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 337 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  39.23 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  36.8 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  41.96 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  38.18 
 
 		 658 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  39 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0983  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.85 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  27.21 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1066  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  43.93 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.78 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.41 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>