20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1925 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1925  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  334  3.9999999999999995e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.235026  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1394  hypothetical protein  69.75 
 
 
162 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0859  hypothetical protein  62.11 
 
 
165 aa  222  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0945  hypothetical protein  59.88 
 
 
165 aa  207  6e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  26.29 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1380  putative methylase  26.74 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  28.02 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  27.47 
 
 
202 aa  50.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  25 
 
 
208 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1868  putative methylase  39.18 
 
 
185 aa  48.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.306856 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  26.37 
 
 
202 aa  47.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  33.67 
 
 
199 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0620  methylase  36 
 
 
204 aa  45.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.532955  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  34.02 
 
 
188 aa  44.7  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  28.42 
 
 
202 aa  43.9  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0875  putative methylase  27.93 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  38.04 
 
 
208 aa  42.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  32.99 
 
 
202 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0551  methylase  38.14 
 
 
188 aa  41.2  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.12656  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1381  ribosomal RNA adenine methylase transferase  29.49 
 
 
234 aa  41.2  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>