20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0945 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0945  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0859  hypothetical protein  59.39 
 
 
165 aa  218  3e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1394  hypothetical protein  61.96 
 
 
162 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1925  hypothetical protein  59.88 
 
 
165 aa  207  6e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.235026  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0279  putative methylase  33.33 
 
 
185 aa  58.9  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1380  putative methylase  27.11 
 
 
178 aa  58.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0875  putative methylase  29.78 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0065  putative methylase  28.99 
 
 
199 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.181251  normal  0.0501466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  28.42 
 
 
202 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1957  putative methylase  35.58 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  26.74 
 
 
202 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  27.68 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  38.89 
 
 
288 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1572  hypothetical protein  32.71 
 
 
193 aa  45.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0250932 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2670  methylase  33.33 
 
 
208 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  29.59 
 
 
202 aa  43.9  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  25.41 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  31.03 
 
 
414 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1804  methylase  25.83 
 
 
207 aa  41.6  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246958  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1791  methyltransferase small  30 
 
 
378 aa  41.6  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>