More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5022 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  441  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  79.72 
 
 
217 aa  346  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  78.34 
 
 
217 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  76.96 
 
 
219 aa  319  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  78.14 
 
 
219 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  77.52 
 
 
220 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  77.52 
 
 
220 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  77.1 
 
 
218 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  76.74 
 
 
219 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  75.58 
 
 
219 aa  307  6.999999999999999e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  43.72 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  43.95 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  43.8 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  43.07 
 
 
218 aa  112  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  44.53 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  42.86 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  43.8 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  40 
 
 
219 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  44.29 
 
 
216 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  36.99 
 
 
223 aa  99.4  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  39.42 
 
 
218 aa  99  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  35.15 
 
 
232 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  43.88 
 
 
219 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  42.52 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  42.52 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  41.01 
 
 
232 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  41.01 
 
 
216 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  38.65 
 
 
216 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  33.73 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  36.5 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  39.86 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  35.97 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  41.73 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  38.71 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  39.16 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  41.73 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  42.55 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  40 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  40.94 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  37.5 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  43.7 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  36.64 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  46.91 
 
 
338 aa  68.2  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  36.36 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  42.19 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1051  putative methylase  44.59 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  45.95 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  44.09 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  37.04 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  36.64 
 
 
229 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  43.24 
 
 
202 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  32.09 
 
 
233 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.95 
 
 
298 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.95 
 
 
298 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  33.91 
 
 
240 aa  61.6  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.95 
 
 
298 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  39.09 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  32.76 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.24 
 
 
300 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  45.63 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.24 
 
 
300 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.24 
 
 
300 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  42.19 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  34.92 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  29.09 
 
 
246 aa  58.9  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1069  putative methylase  44.59 
 
 
202 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  46.15 
 
 
311 aa  58.5  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  34.38 
 
 
247 aa  58.5  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.24 
 
 
300 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3066  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.02 
 
 
304 aa  58.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.84 
 
 
295 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2867  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.86 
 
 
297 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712304  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1671  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.75 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.216755  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  42.86 
 
 
299 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  56 
 
 
294 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  56 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.24 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14081  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.07 
 
 
305 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0500355  normal  0.0701563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.53 
 
 
300 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.54 
 
 
300 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.54 
 
 
300 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.54 
 
 
300 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.96 
 
 
300 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.49 
 
 
295 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0180  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.89 
 
 
296 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0841101 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  54 
 
 
295 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.08 
 
 
300 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  35.4 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4117  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.55 
 
 
293 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0350894  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.54 
 
 
300 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3963  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.11 
 
 
293 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00574631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.16 
 
 
296 aa  56.2  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  41.9 
 
 
216 aa  55.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.89 
 
 
300 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.89 
 
 
300 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.89 
 
 
300 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.89 
 
 
300 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>