160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6390 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 266 aa  521  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  86.87 
 
 		 266 aa  350  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  61.75 
 
 		 282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  67.59 
 
 		 282 aa  270  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  67.13 
 
 		 282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  59.07 
 
 		 272 aa  258  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  62.23 
 
 		 269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  61.17 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.56 
 
 		 264 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  59.57 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  53 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  47.76 
 
 		 269 aa  201  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  45.02 
 
 		 290 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  49.13 
 
 		 267 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  43.48 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  44.15 
 
 		 278 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  46.44 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  43.59 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  43.75 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  45.54 
 
 		 326 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  42.26 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  36.6 
 
 		 273 aa  99.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1879  TPR repeat-containing protein  39.18 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1891  TPR repeat-containing protein  39.18 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2048  hypothetical protein  39.18 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00753525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2453  hypothetical protein  38.14 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1674  Flp pilus assembly protein TadD  39.18 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.814702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0330  hypothetical protein  39.18 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.159096  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 542 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 589 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 505 aa  55.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  30.22 
 
 		 587 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3427  TPR repeat-containing protein  38.14 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  30.22 
 
 		 545 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.25 
 
 		 795 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  28.34 
 
 		 955 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3934  TPR repeat-containing protein  36.45 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 667 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 612 aa  53.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  23.89 
 
 		 619 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  34.29 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  27.17 
 
 		 425 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 566 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 563 aa  49.7  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  25.81 
 
 		 621 aa  49.3  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  30.68 
 
 		 572 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  25.81 
 
 		 621 aa  49.3  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 315 aa  48.9  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  25.56 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.48 
 
 		 762 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  28.87 
 
 		 792 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1714 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  28.48 
 
 		 762 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0312  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.542961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 621 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  26 
 
 		 623 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 		 589 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  23.53 
 
 		 677 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14850  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  28.74 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 629 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  37.35 
 
 		 480 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  32.2 
 
 		 864 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  29.52 
 
 		 395 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.51 
 
 		 574 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  25.32 
 
 		 614 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.72 
 
 		 415 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 573 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 607 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.33 
 
 		 573 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.68 
 
 		 882 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 566 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  44.87 
 
 		 467 aa  46.6  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 884 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 610 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.68 
 
 		 603 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  26.99 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  29.82 
 
 		 430 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  31.9 
 
 		 648 aa  45.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.11 
 
 		 882 aa  45.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  25 
 
 		 603 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  39.62 
 
 		 503 aa  45.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  34.19 
 
 		 2679 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  31.25 
 
 		 584 aa  45.4  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2185  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.95 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  27.89 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.91 
 
 		 576 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.09 
 
 		 714 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 553 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 		 1600 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5072  hypothetical protein  28.33 
 
 		 594 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.05 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 562 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 2651 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.19 
 
 		 610 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 543 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>