More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0427 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
273 aa  543  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  42.44 
 
 
326 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  40.7 
 
 
268 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4586  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  42.25 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  42.63 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  40.72 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  38.34 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  43.37 
 
 
281 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  42.35 
 
 
278 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  41.24 
 
 
262 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  44.39 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  36.93 
 
 
269 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.67 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  38.34 
 
 
279 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  41.41 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.38 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  37.43 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  36.68 
 
 
272 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.67 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6390  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6795  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.08 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
505 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  28.83 
 
 
545 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  29.73 
 
 
955 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
878 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.21 
 
 
587 aa  68.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  38.41 
 
 
626 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  38.41 
 
 
614 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  38.41 
 
 
614 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  38.41 
 
 
614 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.78 
 
 
810 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
750 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 
1737 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 
572 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
543 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.41 
 
 
626 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
639 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2048  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.14 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218201  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
589 aa  65.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  37.41 
 
 
612 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 
685 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 
700 aa  63.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.11 
 
 
816 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  38.93 
 
 
636 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.29 
 
 
632 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
203 aa  62  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.8 
 
 
875 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0901  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.67 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
4079 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 
637 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
900 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
402 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  31.71 
 
 
572 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0114  tetratricopeptide TPR_2  34.43 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
649 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
362 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.41 
 
 
633 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 
927 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
546 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 
718 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
621 aa  60.1  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 
611 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 
708 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 
635 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 
635 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25 
 
 
725 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
909 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  31.28 
 
 
1677 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.41 
 
 
633 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2662  tetratricopeptide domain-containing protein  35.51 
 
 
557 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0513511  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
631 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
824 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 
502 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
465 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
607 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
585 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  30.13 
 
 
573 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
767 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1550  predicted protein  27.33 
 
 
381 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.058598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  26.52 
 
 
619 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.48 
 
 
714 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
1085 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
3145 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.67 
 
 
762 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 
610 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  30.67 
 
 
762 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.22 
 
 
610 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 
2240 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.54 
 
 
340 aa  56.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.94 
 
 
626 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 
579 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
288 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0673  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 
283 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  35.11 
 
 
417 aa  55.8  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  30.67 
 
 
299 aa  55.8  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
602 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
566 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 
649 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>