13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1874 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1874  sporulation related  100 
 
 		 541 aa  1041    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.138389  normal  0.137004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3939  sporulation domain-containing protein  41.1 
 
 		 483 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1140  hypothetical protein  45.07 
 
 		 730 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  32.45 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  29.79 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  30.32 
 
 		 269 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.32 
 
 		 264 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 290 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 269 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  28.26 
 
 		 279 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  32.67 
 
 		 272 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  31.1 
 
 		 267 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 1096 aa  43.5  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>