13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2765 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2765  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 291 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 203 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2882  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.15 
 
 		 767 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 744 aa  49.3  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 416 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2273  putative cytochrome c-type biogenesis protein precursor  39.71 
 
 		 404 aa  46.2  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.21015  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  23.96 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.42 
 
 		 579 aa  43.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 566 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1600  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 162 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188686  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 607 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.37 
 
 		 254 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 339 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>