104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1600 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1600  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0541  TPR repeat-containing protein  43.27 
 
 
190 aa  87  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  36.36 
 
 
222 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
189 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
203 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0440  TPR repeat-containing protein  40.66 
 
 
272 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3075  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
240 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 
762 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 
670 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2959  cellulose binding, type IV  29.91 
 
 
230 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
544 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.35 
 
 
1764 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 
1252 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 
1252 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1226  hypothetical protein  31.43 
 
 
243 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00201205  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.93 
 
 
277 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
465 aa  50.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  27.78 
 
 
174 aa  48.5  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
393 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  27.62 
 
 
196 aa  47.8  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
792 aa  47.8  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
1121 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
265 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 
3560 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  22.56 
 
 
820 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
319 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2503  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
195 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
274 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.71 
 
 
589 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  36.84 
 
 
795 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  29.52 
 
 
246 aa  44.7  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
595 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
190 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  32.1 
 
 
1077 aa  44.3  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.71 
 
 
589 aa  44.3  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  25.22 
 
 
198 aa  44.3  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
750 aa  44.3  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 
395 aa  44.3  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
1297 aa  43.9  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  29.17 
 
 
577 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  26 
 
 
287 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
566 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 
1038 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
697 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0899  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.31 
 
 
245 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
708 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
878 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  35.44 
 
 
503 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.73 
 
 
810 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.64 
 
 
397 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3296  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.57 
 
 
708 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.64 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
608 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 
249 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  29.17 
 
 
577 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
649 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
649 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 
761 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
587 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  41.07 
 
 
771 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
847 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.23 
 
 
190 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1922  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
142 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2765  tetratricopeptide TPR_2  34.72 
 
 
291 aa  42  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.580196 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1460  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
135 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.057123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  36.14 
 
 
703 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0047  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
506 aa  42  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0614925  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 
4079 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
593 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 
605 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.6 
 
 
565 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
732 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
711 aa  41.6  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14850  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  39.06 
 
 
252 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  24.24 
 
 
661 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
646 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.2 
 
 
274 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
1005 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
1450 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
643 aa  41.2  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 
612 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 
265 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
1106 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
274 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.1 
 
 
760 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
649 aa  41.2  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 
200 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 
714 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 
237 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 
3145 aa  40.8  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
1737 aa  40.8  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 
890 aa  40.8  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
1192 aa  40.8  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
522 aa  40.8  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
597 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  31.08 
 
 
385 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 
784 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>