26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2959 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2959  cellulose binding, type IV  100 
 
 		 230 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  30.34 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1226  hypothetical protein  30.61 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0541  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0440  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1228  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1600  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 162 aa  52.4  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3075  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 3145 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 		 1252 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 		 1252 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0456  MSHA biogenesis protein MshN, putative  31.78 
 
 		 399 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 565 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 833 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  25.16 
 
 		 1154 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 589 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  37.33 
 
 		 1067 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2758  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 414 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 879 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 878 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1345  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 140 aa  42.4  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00066539  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 1161 aa  42  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1288  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 329 aa  42  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.130508  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 374 aa  42  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.55 
 
 		 330 aa  41.6  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>