68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0440 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0440  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 272 aa  552  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3075  TPR repeat-containing protein  60.58 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0541  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 		 190 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1228  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  27.01 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2959  cellulose binding, type IV  28.03 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1226  hypothetical protein  32.81 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1600  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 879 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 643 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 393 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 503 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.35 
 
 		 190 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0727  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  25 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3392  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.57 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 191 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 1005 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.06 
 
 		 1034 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  30.91 
 
 		 732 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  28.07 
 
 		 779 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 593 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 762 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 190 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  41.1 
 
 		 795 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.36 
 
 		 620 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.93 
 
 		 314 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  30.17 
 
 		 865 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 1406 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 574 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2108  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 662 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.93 
 
 		 1764 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 502 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 502 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 620 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  32.94 
 
 		 502 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1049 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3465  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.16 
 
 		 451 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0563364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0999  serine/threonine kinase protein  28.4 
 
 		 896 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 927 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 187 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  27.95 
 
 		 706 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 546 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3321  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 453 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 713 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  28.78 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3401  Tetratricopeptide TPR_4  31.16 
 
 		 453 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0349174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  29.13 
 
 		 417 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1658  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  33.72 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  29.32 
 
 		 715 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 717 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 717 aa  43.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 3560 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1085 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 3145 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 657 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 1121 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 827 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 615 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 251 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2051  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 292 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00932156  normal  0.0498095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>