227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5385 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
251 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  96.02 
 
 
251 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  96.02 
 
 
251 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  94.42 
 
 
251 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  92.03 
 
 
251 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  95.93 
 
 
221 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  95.02 
 
 
221 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  78.57 
 
 
283 aa  325  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  78.17 
 
 
283 aa  319  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  78.17 
 
 
283 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  77.59 
 
 
240 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  77.59 
 
 
240 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  77.59 
 
 
240 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  77.59 
 
 
240 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  77.59 
 
 
240 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  57.53 
 
 
254 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  53.5 
 
 
298 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  63.16 
 
 
218 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  40.34 
 
 
387 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  47.31 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  43.92 
 
 
196 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  43.96 
 
 
216 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  42.18 
 
 
215 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  51.67 
 
 
219 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  44.96 
 
 
345 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  42.66 
 
 
188 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  43.8 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  45.19 
 
 
366 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  40 
 
 
373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  40.79 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  38.93 
 
 
344 aa  116  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  48.28 
 
 
190 aa  115  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  48.28 
 
 
190 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 
178 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  39.26 
 
 
460 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  42.19 
 
 
251 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 
302 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
625 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
315 aa  58.5  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 
732 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
657 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 
878 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.3 
 
 
820 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 
4489 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
713 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 
649 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
213 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.41 
 
 
810 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
1406 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
3560 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
162 aa  52.8  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.6 
 
 
586 aa  52.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
280 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
776 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 
890 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2398  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
1085 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 
635 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.71 
 
 
715 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.83 
 
 
1694 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
265 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.3 
 
 
647 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.58 
 
 
289 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.04 
 
 
836 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.5 
 
 
620 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25151  predicted protein  32 
 
 
954 aa  48.9  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160551  normal  0.0799284 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
649 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
1276 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
3145 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
289 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
649 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
573 aa  48.5  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 
645 aa  48.5  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
391 aa  48.5  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
646 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
909 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.85 
 
 
714 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
761 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  24.64 
 
 
682 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.63 
 
 
988 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
620 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3430  hypothetical protein  25.23 
 
 
695 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112777  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.09 
 
 
1979 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
573 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
405 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  42.86 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.43 
 
 
626 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2107  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.5 
 
 
2492 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.43 
 
 
626 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 
567 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
750 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.43 
 
 
614 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
614 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>