194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A3155 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 283 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 283 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 240 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 240 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 240 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 240 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  99.58 
 
 		 240 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  94.17 
 
 		 283 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  77.59 
 
 		 251 aa  358  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  78.84 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  78.84 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  78.42 
 
 		 251 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  78.42 
 
 		 251 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  81.5 
 
 		 221 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  81.5 
 
 		 221 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  60.77 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  62.93 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  64.42 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  44 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  39.87 
 
 		 387 aa  131  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  44.2 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  45.24 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  44.6 
 
 		 345 aa  125  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  50.83 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 190 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 190 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  44.59 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  41.98 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  40.56 
 
 		 188 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  40.12 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  40.56 
 
 		 373 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  46.09 
 
 		 366 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  41.86 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  43.85 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  38.67 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  41.09 
 
 		 344 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  39.01 
 
 		 393 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  42.03 
 
 		 460 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.17 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 625 aa  83.2  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.3 
 
 		 820 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 1406 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 878 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 732 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 649 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 810 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 657 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 713 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 162 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 3560 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  35 
 
 		 620 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 927 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 750 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  33.72 
 
 		 890 aa  48.9  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 448 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 399 aa  48.5  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.81 
 
 		 758 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 4489 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 3172 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 739 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.68 
 
 		 743 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 3145 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.36 
 
 		 715 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.96 
 
 		 1694 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 750 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 405 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 761 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25151  predicted protein  28.85 
 
 		 954 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160551  normal  0.0799284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.51 
 
 		 586 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  26.47 
 
 		 638 aa  46.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.38 
 
 		 626 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 909 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.38 
 
 		 626 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 620 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 573 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 614 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 317 aa  45.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 649 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 1421 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 649 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.38 
 
 		 614 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2768  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 187 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.38 
 
 		 614 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 614 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 614 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 391 aa  45.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 635 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 289 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.52 
 
 		 738 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 635 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 646 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 611 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>