More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0047 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0047  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
506 aa  986    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0614925  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0681  TPR repeat-containing protein  44.32 
 
 
549 aa  362  1e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.607702  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0121  TPR repeat-containing protein  52.56 
 
 
576 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.416255 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  54.63 
 
 
542 aa  186  6e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 
1276 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 
909 aa  74.7  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.58 
 
 
795 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
739 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.75 
 
 
1694 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 
685 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 
1486 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  31.93 
 
 
395 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 
637 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 
927 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 
472 aa  67.8  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  20 
 
 
714 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
3560 aa  67  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
405 aa  67  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
543 aa  67  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
583 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
1827 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 
718 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
162 aa  66.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
612 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
681 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.19 
 
 
816 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
3035 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  34.04 
 
 
700 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
750 aa  64.7  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.82 
 
 
603 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
878 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 
4489 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  30.83 
 
 
732 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  34.55 
 
 
540 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
711 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 
219 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 
750 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 
362 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
643 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
402 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.19 
 
 
397 aa  62  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 
465 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
399 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.06 
 
 
810 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
3301 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
3172 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30 
 
 
714 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.41 
 
 
626 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  32.2 
 
 
437 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  27.5 
 
 
623 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.32 
 
 
1737 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
649 aa  60.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  31.29 
 
 
338 aa  60.5  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
968 aa  60.5  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  31.43 
 
 
267 aa  60.1  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  25.86 
 
 
425 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
686 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  29.6 
 
 
430 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  25.93 
 
 
626 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
452 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  25.93 
 
 
626 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 
637 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
494 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
614 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  25.93 
 
 
614 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  36.89 
 
 
779 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  25.93 
 
 
614 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  29.01 
 
 
545 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 
611 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
244 aa  58.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
614 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
732 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
1094 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
776 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  31.21 
 
 
467 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
589 aa  58.5  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  32.73 
 
 
473 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 
323 aa  58.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 
635 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 
635 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  35.05 
 
 
745 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
3145 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.9 
 
 
560 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
279 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 
847 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
567 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
653 aa  57  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  27.12 
 
 
653 aa  57  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
715 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  31.86 
 
 
864 aa  57  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 
766 aa  57  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
534 aa  56.6  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  29.17 
 
 
566 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
615 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
602 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 
274 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  19.21 
 
 
232 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  30.4 
 
 
865 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2060  tetratricopeptide TPR_2  26.52 
 
 
984 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.69 
 
 
820 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>