15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1460 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1460  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 135 aa  264  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.057123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0744  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1211  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 237 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0177658 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0640  TPR repeat-containing protein  42.37 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0712  hypothetical protein  32.88 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.53 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.82 
 
 		 358 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 		 624 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0811  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.38 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.940424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  51.22 
 
 		 340 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3537  glycosyl transferase family 2  41.54 
 
 		 397 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 224 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.21 
 
 		 639 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  42.47 
 
 		 1106 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.84 
 
 		 1106 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>