136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0612 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0612  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 171 aa  346  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5130  TPR repeat-containing protein  56.77 
 
 		 175 aa  175  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.12 
 
 		 173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4391  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.24 
 
 		 172 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3786  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.9 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.849163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1521  hypothetical protein  50.46 
 
 		 120 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689528  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2572  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.51 
 
 		 161 aa  94  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  30.67 
 
 		 299 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 1038 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 315 aa  52  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2682  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 247 aa  51.6  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  normal  0.584749 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 247 aa  50.8  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  28.08 
 
 		 395 aa  50.8  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2020  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 243 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45280  cytochrome c-type biogenesis protein  30.7 
 
 		 407 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.614364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  42.03 
 
 		 268 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0141  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 419 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455814  normal  0.196734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.89 
 
 		 290 aa  48.5  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4392  tetratricopeptide TPR_4  38.27 
 
 		 498 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0572051  normal  0.357781 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  41.43 
 
 		 262 aa  48.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  32.38 
 
 		 279 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0990  tetratricopeptide TPR_2  31.69 
 
 		 281 aa  47.8  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  33.64 
 
 		 281 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 269 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 629 aa  47.4  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1256  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.13 
 
 		 261 aa  47.8  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0295  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  33.77 
 
 		 452 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 1421 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 711 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  33.72 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 326 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 589 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 435 aa  45.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.03 
 
 		 546 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2558  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 441 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 611 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  40 
 
 		 436 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 264 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3128  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  22.03 
 
 		 332 aa  45.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 597 aa  45.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 767 aa  44.7  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 566 aa  44.7  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4254  lysM domain-containing protein  23.53 
 
 		 524 aa  44.3  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.305557  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  36.23 
 
 		 269 aa  44.3  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 249 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 273 aa  44.3  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 249 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  28.12 
 
 		 344 aa  44.3  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 1252 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.75 
 
 		 707 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  31.63 
 
 		 321 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 1252 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 297 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 291 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 649 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 522 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.25 
 
 		 884 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14850  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  27.72 
 
 		 252 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.08 
 
 		 689 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.83 
 
 		 837 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2783  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 403 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  38.46 
 
 		 889 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3844  cytochrome c-type biogenesis protein  34.44 
 
 		 406 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.59 
 
 		 880 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 587 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 297 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 		 766 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 		 917 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 		 557 aa  43.9  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  35.71 
 
 		 278 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 313 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 448 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 291 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.61 
 
 		 594 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 265 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  51.06 
 
 		 292 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 615 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 563 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 681 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 927 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 576 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  42.25 
 
 		 260 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  31.03 
 
 		 820 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  36.84 
 
 		 1073 aa  42.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1217  putative fimbrial biogenesis and twitching motility protein  26.61 
 
 		 237 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.544829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 405 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2098  tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein  28.57 
 
 		 653 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.903394  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 505 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.35 
 
 		 235 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 613 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  37.14 
 
 		 267 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 3145 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 279 aa  42  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 878 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1184  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.72 
 
 		 249 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 409 aa  42  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  34.29 
 
 		 278 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0420  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.72 
 
 		 249 aa  42  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209508 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>