35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4391 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4391  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0612  tetratricopeptide TPR_2  39.24 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.74 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3786  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.42 
 
 		 181 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.849163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1521  hypothetical protein  38.6 
 
 		 120 aa  88.6  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689528  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5130  TPR repeat-containing protein  36.02 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2572  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.2 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 409 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1722  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 		 208 aa  50.8  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 607 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 409 aa  47.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  27.94 
 
 		 562 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  27.59 
 
 		 395 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 409 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27 
 
 		 364 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 607 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 607 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  25.23 
 
 		 321 aa  45.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 607 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  25.36 
 
 		 456 aa  44.3  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 		 452 aa  44.3  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 1038 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 435 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2098  tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein  26.32 
 
 		 653 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.903394  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  27.16 
 
 		 643 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 607 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  25.4 
 
 		 503 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 927 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 607 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  26.45 
 
 		 607 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0990  tetratricopeptide TPR_2  35.53 
 
 		 281 aa  42  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  38.24 
 
 		 262 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 3145 aa  41.2  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 229 aa  41.2  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>