30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1139 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1139  sporulation related  100 
 
 		 242 aa  473  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1090  hypothetical protein  37.45 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3934  sporulation domain-containing protein  32.22 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  42.11 
 
 		 1079 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  36.25 
 
 		 911 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  31.58 
 
 		 966 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  40.79 
 
 		 1108 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  26.28 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 990 aa  52.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  33.33 
 
 		 978 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  30 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  32.18 
 
 		 993 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  38.36 
 
 		 467 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  29.79 
 
 		 440 aa  48.9  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  35.44 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  33.78 
 
 		 458 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 463 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2942  hypothetical protein  34.18 
 
 		 328 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1587  sporulation domain-containing protein  34.18 
 
 		 328 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1508  hypothetical protein  31.58 
 
 		 342 aa  45.8  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  33.66 
 
 		 511 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  25.97 
 
 		 727 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0605  sporulation domain-containing protein  39.47 
 
 		 364 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690459  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  31.08 
 
 		 474 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  30.67 
 
 		 468 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  32.59 
 
 		 505 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  30.84 
 
 		 545 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  34.62 
 
 		 356 aa  42  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  29.73 
 
 		 472 aa  41.6  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>