47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2794 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  70.74 
 
 		 505 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  100 
 
 		 535 aa  1056    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  60.54 
 
 		 545 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  46.8 
 
 		 481 aa  326  6e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  59.6 
 
 		 480 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  43.24 
 
 		 470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  40.73 
 
 		 529 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  36.47 
 
 		 281 aa  153  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  32.47 
 
 		 474 aa  124  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 990 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  30.99 
 
 		 993 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  32.87 
 
 		 978 aa  106  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  29.14 
 
 		 966 aa  103  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  32.28 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  28.91 
 
 		 468 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  32.37 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  31.67 
 
 		 463 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  46.59 
 
 		 1079 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  30.45 
 
 		 511 aa  84  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  47.5 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  45.68 
 
 		 1108 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  49.32 
 
 		 533 aa  70.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  28.45 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  43.04 
 
 		 727 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  42.5 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  35.79 
 
 		 356 aa  67  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 277 aa  67  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  38.27 
 
 		 835 aa  62.8  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  31.15 
 
 		 458 aa  55.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2393  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.37 
 
 		 573 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0818028  normal  0.363702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  29.11 
 
 		 378 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  38.37 
 
 		 243 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  28.57 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  30.95 
 
 		 363 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  33.75 
 
 		 340 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 363 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 340 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 321 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  29.89 
 
 		 396 aa  45.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  30.49 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  30.49 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  30.49 
 
 		 307 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4569  hypothetical protein  40 
 
 		 495 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0942693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  23.37 
 
 		 237 aa  43.9  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1699  peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  28 
 
 		 587 aa  43.9  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0899262  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0790  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.36 
 
 		 489 aa  43.5  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>