30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2353 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 533 aa  1026    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  40.78 
 
 		 480 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  46.58 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  49.32 
 
 		 535 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1720  sporulation domain-containing protein  36.14 
 
 		 198 aa  68.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15408  normal  0.157797 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  40.82 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  43.84 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  39.73 
 
 		 545 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3310  TPR repeat-containing protein  44.59 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.365778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  42.31 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  39.76 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  36 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  36.73 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  31.51 
 
 		 277 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  35.62 
 
 		 281 aa  54.3  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  33.05 
 
 		 1079 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  37.21 
 
 		 529 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  36.99 
 
 		 463 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  36.99 
 
 		 727 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  35.53 
 
 		 1108 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  36.99 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 966 aa  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  31.08 
 
 		 237 aa  47.4  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  38.89 
 
 		 396 aa  47  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  34.67 
 
 		 911 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  35.8 
 
 		 1133 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  37.5 
 
 		 990 aa  44.3  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1422  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  38.64 
 
 		 280 aa  44.3  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.162088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2790  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 		 305 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  37.5 
 
 		 978 aa  43.5  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>