More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0605 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0605  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 364 aa  711    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690459  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  41.77 
 
 		 396 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3066  Sel1 repeat-containing protein  39.04 
 
 		 432 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.43 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 		 448 aa  86.3  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  38.93 
 
 		 831 aa  86.3  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  40.37 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.88 
 
 		 528 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  35.86 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  38.73 
 
 		 684 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  38.92 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  42.11 
 
 		 789 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  35.82 
 
 		 961 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  44.12 
 
 		 557 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  40.35 
 
 		 1493 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.54 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  47.13 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.93 
 
 		 1402 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  36.13 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 181 aa  78.2  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  41 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  35.34 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  37.1 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0178  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.93 
 
 		 679 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  37.69 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.96 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  34.81 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1277  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.37 
 
 		 481 aa  75.9  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  36.09 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  37.72 
 
 		 185 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  39.83 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  35.09 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2996  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.25 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  38.32 
 
 		 2413 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  29.81 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  34.35 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1877 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  39.6 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  35.34 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.54 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  38.46 
 
 		 838 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  38.52 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.09 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  44.09 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  39.64 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  39.64 
 
 		 490 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3770  Sel1 domain-containing protein  25.54 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.476398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1037 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  33.33 
 
 		 765 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.08 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  28.49 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  38.24 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  34.62 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  33.57 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  44 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0510  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  32.92 
 
 		 236 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.14 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1085  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.43 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  37.17 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  38.26 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  26.35 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  42.7 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3240  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.01 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  36.97 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  34.78 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  39.45 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  38.1 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  37.29 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  42.45 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.55 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  33.05 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  38.46 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  31.93 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  34.78 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.3 
 
 		 225 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.58 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.55 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  34.48 
 
 		 117 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  35.77 
 
 		 536 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.97 
 
 		 231 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.75 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.99 
 
 		 211 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 1032 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  42.39 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  32.84 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35.25 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  36.54 
 
 		 115 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.22 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  40.52 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  39.81 
 
 		 685 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.11 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4119  Sel1 domain-containing protein  36.09 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  38.1 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.17 
 
 		 1002 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.5 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.81 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  37.11 
 
 		 1242 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  37.78 
 
 		 731 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>