More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3770 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3770  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 268 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.476398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4453  Sel1 domain-containing protein  61.94 
 
 		 266 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0976  Sel1 domain-containing protein  44.96 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.135872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0528  Sel1 domain-containing protein  41.06 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4035  Sel1 domain-containing protein  39.92 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.163286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0527  Sel1 domain-containing protein  41.87 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3249  Sel1 domain-containing protein  34.94 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0529  Sel1 domain-containing protein  37.21 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  38.17 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  35.71 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1747  hypothetical protein  27.8 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.85 
 
 		 831 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  37.1 
 
 		 684 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.55 
 
 		 1037 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.56 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  37.4 
 
 		 490 aa  72.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  37.4 
 
 		 490 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  38.02 
 
 		 789 aa  72  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.1 
 
 		 890 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  33.86 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  35.38 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  29.86 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  35.56 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.11 
 
 		 1402 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  31.65 
 
 		 961 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  35.83 
 
 		 536 aa  68.9  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0605  sporulation domain-containing protein  26.45 
 
 		 364 aa  68.6  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690459  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  35.61 
 
 		 557 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34.51 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  30.15 
 
 		 359 aa  67  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  38.14 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.14 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  32.38 
 
 		 680 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0075  putative highly acidic protein  25.73 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00000264098  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  25.6 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  33.61 
 
 		 172 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3066  Sel1 repeat-containing protein  27.15 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  35.45 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.03 
 
 		 163 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  38.14 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 1032 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  32.17 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.54 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  33.33 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.84 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  30.29 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  36.75 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  33.91 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1493 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.9 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  34.17 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3794  Sel1 domain-containing protein  29.44 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889747 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.68 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  29.92 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  25.81 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  40.38 
 
 		 1141 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  38.68 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.15 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.62 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  24.63 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1877 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0991  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.25 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.659562  normal  0.202953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.57 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  30.08 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  31.48 
 
 		 679 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1366 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  34.09 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  28.75 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  33.07 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  26.77 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2413 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  30.33 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  32.3 
 
 		 850 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  33.06 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  35.9 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.36 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.58 
 
 		 865 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  24.53 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 976 aa  58.9  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.63 
 
 		 392 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  30.94 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4713  Sel1 domain-containing protein  31.93 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.767637 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  24.14 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  40.57 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4191  Sel1 domain-containing protein  31.93 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  31.09 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.3 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  27.23 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  32.5 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4775  Sel1-like  30.71 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  27.95 
 
 		 817 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  30.15 
 
 		 838 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5474  Sel1 domain-containing protein  31.09 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617627  normal  0.0666513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  31.65 
 
 		 722 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3558  Sel1 repeat-containing protein  31.09 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4809  Sel1 domain-containing protein  31.09 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  29.92 
 
 		 509 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>