More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3066 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3066  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 		 432 aa  848    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  42.82 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0605  sporulation domain-containing protein  40.74 
 
 		 364 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690459  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  39.69 
 
 		 831 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  35.38 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  36.81 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.3 
 
 		 528 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.68 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  30.18 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.21 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  33.81 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1402 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.36 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.13 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  29.17 
 
 		 684 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  34.81 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  38.66 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  30.06 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  27.61 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.69 
 
 		 961 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.33 
 
 		 241 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  33.96 
 
 		 359 aa  69.7  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.12 
 
 		 789 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  34.85 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1110 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  31.87 
 
 		 1200 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  31.87 
 
 		 1200 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.85 
 
 		 1493 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3246  Sel1 domain-containing protein  37.5 
 
 		 1145 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516483 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  28.91 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.12 
 
 		 2413 aa  67  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.71 
 
 		 209 aa  67  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  40.38 
 
 		 274 aa  67  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1037 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.81 
 
 		 557 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  35.34 
 
 		 536 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  35.54 
 
 		 255 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2699  Sel1 domain-containing protein repeat-containing protein  30.63 
 
 		 202 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0148338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  33.61 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  34.4 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1877 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.87 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.62 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  37.62 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1505  Sel1 domain protein repeat-containing protein  46.34 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.191468  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  35.34 
 
 		 961 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  36.09 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  31.1 
 
 		 1081 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.74 
 
 		 1088 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  34.62 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.07 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  33.88 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3770  Sel1 domain-containing protein  27.15 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.476398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  31.82 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  36.04 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0178  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.07 
 
 		 679 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.61 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  34.46 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 1032 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  36.13 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.88 
 
 		 232 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.81 
 
 		 865 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.57 
 
 		 685 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  30.12 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  33.33 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1002 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  32.28 
 
 		 1044 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  47.62 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.9 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  32.28 
 
 		 1078 aa  60.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  33.12 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  34.82 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  27.04 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.39 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.6 
 
 		 838 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  41.98 
 
 		 1796 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.87 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  36.61 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1108  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.65 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633913  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1337  Sel1 domain-containing protein  36.84 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0906035  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.75 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.38 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  29 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  34.19 
 
 		 746 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34.06 
 
 		 976 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 363 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.3 
 
 		 255 aa  57  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  26.17 
 
 		 233 aa  57  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  27.67 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4237  Sel1 domain-containing protein  39.76 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000679734 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  49.12 
 
 		 1910 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  41.05 
 
 		 599 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  34.45 
 
 		 679 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  30.71 
 
 		 218 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  33.98 
 
 		 115 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>