238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1337 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1337  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0906035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0946  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.37 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.07 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.13 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  34.51 
 
 		 684 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  28.88 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.88 
 
 		 831 aa  62  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  32.31 
 
 		 267 aa  61.6  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  33.61 
 
 		 557 aa  61.6  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  33.57 
 
 		 489 aa  61.2  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  40.2 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  33.07 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.19 
 
 		 2413 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  32.76 
 
 		 961 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  31.13 
 
 		 746 aa  59.3  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.72 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35.96 
 
 		 490 aa  58.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  33.33 
 
 		 679 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  34.23 
 
 		 396 aa  58.9  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  33.07 
 
 		 376 aa  58.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1037 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  33.6 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  36.13 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  33.61 
 
 		 505 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1281 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3066  Sel1 repeat-containing protein  36.84 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.51 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  33.91 
 
 		 680 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  34.59 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  33.87 
 
 		 1493 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  30.77 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  30.77 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.26 
 
 		 789 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  29.91 
 
 		 765 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  35.92 
 
 		 523 aa  55.5  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  33.98 
 
 		 331 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1402 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 393 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2699  Sel1 domain-containing protein repeat-containing protein  34.65 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0148338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.71 
 
 		 305 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.06 
 
 		 528 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  35.77 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  33.96 
 
 		 331 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  32.77 
 
 		 913 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  24.88 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3189  Sel1-like protein  31.37 
 
 		 265 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270269  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.68 
 
 		 341 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.25 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  36.97 
 
 		 249 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  29.84 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.06 
 
 		 271 aa  52.8  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3510  Sel1 domain-containing protein  30.43 
 
 		 512 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.765295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.07 
 
 		 248 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  30.95 
 
 		 254 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  32.03 
 
 		 325 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.07 
 
 		 248 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  33.01 
 
 		 331 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  31.34 
 
 		 552 aa  52.4  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 976 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0954  Sel1 domain-containing protein  35.48 
 
 		 478 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.683818  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  33.01 
 
 		 331 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 303 aa  52  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 223 aa  51.6  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 448 aa  52  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.25 
 
 		 325 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 325 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  37.37 
 
 		 509 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  37.37 
 
 		 509 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  40.26 
 
 		 257 aa  51.2  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 1032 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1002 aa  51.2  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  33.33 
 
 		 839 aa  51.2  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  28.57 
 
 		 1044 aa  51.2  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  28.57 
 
 		 1078 aa  51.2  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0247  CoA-binding domain-containing protein  28.26 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.71 
 
 		 865 aa  50.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.06 
 
 		 225 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  32.48 
 
 		 285 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1107  hypothetical protein  30.21 
 
 		 935 aa  50.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.489454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  37.37 
 
 		 509 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  31.3 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.34 
 
 		 416 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  37.37 
 
 		 509 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  33.61 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3685  Sel1 domain-containing protein  29.2 
 
 		 512 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.43 
 
 		 318 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  29.35 
 
 		 839 aa  49.3  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  25.51 
 
 		 250 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0442  Sel1 domain-containing protein  29.2 
 
 		 512 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  25.51 
 
 		 250 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  31.9 
 
 		 1475 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5026  Tetratricopeptide TPR_4  34.29 
 
 		 482 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.998204  normal  0.25897 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.03 
 
 		 282 aa  49.3  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1877 aa  49.3  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  32.33 
 
 		 234 aa  49.3  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0241  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.19 
 
 		 480 aa  48.9  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.381439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>