More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3447 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  100 
 
 		 423 aa  842    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 415 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  47.25 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  60.14 
 
 		 278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  58.62 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  51.98 
 
 		 295 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  42.73 
 
 		 265 aa  170  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  56.34 
 
 		 270 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  53.59 
 
 		 260 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  57.04 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  54.25 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  52.12 
 
 		 311 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  46.3 
 
 		 341 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  45.95 
 
 		 263 aa  166  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  43.93 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  54.93 
 
 		 265 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  54.17 
 
 		 264 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  55.1 
 
 		 285 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  33.72 
 
 		 342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  48.84 
 
 		 267 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  34.01 
 
 		 342 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  55.17 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  42.73 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  53.38 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  45.08 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  51.7 
 
 		 333 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  47.37 
 
 		 325 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  51.7 
 
 		 333 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  51.66 
 
 		 322 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  40.3 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  43 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  50.34 
 
 		 333 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  39.73 
 
 		 277 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  43 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  39.29 
 
 		 281 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  41.85 
 
 		 280 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  41.85 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  41.85 
 
 		 280 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  39.29 
 
 		 277 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  39.29 
 
 		 277 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  48.52 
 
 		 324 aa  154  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  46.24 
 
 		 277 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  58.12 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  56 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  53.28 
 
 		 269 aa  150  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  50.66 
 
 		 257 aa  149  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  50 
 
 		 260 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  51.37 
 
 		 323 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  52.31 
 
 		 273 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  52.31 
 
 		 273 aa  143  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  46.47 
 
 		 286 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  40.38 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  57.26 
 
 		 382 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  34.27 
 
 		 394 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  61.21 
 
 		 230 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  56.88 
 
 		 468 aa  140  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  58.72 
 
 		 442 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  56.88 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  56.88 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  49.32 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  50 
 
 		 409 aa  137  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  38.29 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  47.55 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  60.55 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  60.55 
 
 		 419 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  51.09 
 
 		 331 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 408 aa  132  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  60 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  55.93 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  52.46 
 
 		 282 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  52.14 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  55.93 
 
 		 364 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  47.86 
 
 		 258 aa  130  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  48.82 
 
 		 352 aa  130  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  51.72 
 
 		 254 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  50.76 
 
 		 314 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  45.03 
 
 		 281 aa  126  7e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  56.3 
 
 		 283 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  51.89 
 
 		 242 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  51.89 
 
 		 242 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  55.05 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  51.89 
 
 		 230 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  51.89 
 
 		 211 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  51.89 
 
 		 230 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  51.89 
 
 		 211 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  51.89 
 
 		 211 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  56.88 
 
 		 312 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  46.48 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  45.91 
 
 		 346 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  47.47 
 
 		 367 aa  123  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  58.7 
 
 		 206 aa  123  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 202 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  55.36 
 
 		 238 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  51.92 
 
 		 211 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 206 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  34.04 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  42.24 
 
 		 249 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  37.57 
 
 		 243 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>