23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3575 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3575  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
462 aa  847    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409926  normal  0.380426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3167  sporulation related  44.51 
 
 
349 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.085105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2035  sporulation domain-containing protein  42.86 
 
 
533 aa  64.3  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1861  sporulation domain-containing protein  42.7 
 
 
313 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  31.69 
 
 
279 aa  57  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2228  Sporulation domain protein  39.19 
 
 
280 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2738  sporulation domain-containing protein  39.19 
 
 
280 aa  53.9  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.904552  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  41.18 
 
 
255 aa  53.9  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  38.24 
 
 
332 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4771  sporulation domain-containing protein  38.24 
 
 
315 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6837  Sporulation domain protein  39.33 
 
 
307 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1686  sporulation domain-containing protein  41.18 
 
 
249 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3328  sporulation domain-containing protein  35.71 
 
 
263 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  34.17 
 
 
245 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1045  Sporulation domain protein  35.79 
 
 
268 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.827032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0721  Sporulation domain protein  35.44 
 
 
222 aa  46.6  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2876  hypothetical protein  38.2 
 
 
312 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3373  sporulation domain-containing protein  36.59 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0553725  normal  0.16412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0136  Sporulation domain protein  32.26 
 
 
236 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  36.36 
 
 
218 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  30.77 
 
 
290 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4379  sporulation domain-containing protein  33.63 
 
 
306 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.772559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  35.83 
 
 
246 aa  43.9  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>