28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1891 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1891  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  568  1e-161  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  33.71 
 
 
2179 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  26.82 
 
 
1859 aa  59.3  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  26.45 
 
 
2272 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  32 
 
 
1128 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.32 
 
 
2449 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1456  hypothetical protein  37.14 
 
 
172 aa  55.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  31.43 
 
 
1183 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16851  translation initiation factor IF-2  29.94 
 
 
1114 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  28.49 
 
 
1183 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  21.15 
 
 
3333 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  34.06 
 
 
1104 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  30.43 
 
 
1132 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  29.89 
 
 
985 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  41.05 
 
 
968 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16741  translation initiation factor IF-2  36.36 
 
 
1161 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  32.06 
 
 
971 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2411  hypothetical protein  37.31 
 
 
474 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0411768  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0739  YSIRK Gram-positive signal peptide  27.21 
 
 
2035 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  28.4 
 
 
1126 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04131  translation initiation factor IF-2  33.83 
 
 
1124 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  29.52 
 
 
1652 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  21.19 
 
 
926 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  35.14 
 
 
939 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  28.07 
 
 
957 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4394  helicase domain-containing protein  32.58 
 
 
1140 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  22.02 
 
 
3409 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  27.78 
 
 
1176 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>